Profesor de Historia, Geografía y Educación Cívica por la Universidad de La Frontera, Magister en Historia por la Universidad de Santiago de Chile, Doctor por la Universidad de Sevilla. Su área de investigación se orienta a la Historia de Chile e Historia de la Araucanía en los siglos XIX y XX. Desde 1994 es académico del Departamento de Ciencias Sociales, dictando clases en pre y posgrado. Ha participado, en calidad de investigador responsable y co-investigador en diversos proyectos Fondecyt y Diufro. Sus investigaciones y publicaciones buscan dar cuenta de los procesos de transformación y resistencias que experimentó la Araucanía a partir de 1850, abordando aspecto asociados a los sujetos de estas historias y a las transformaciones del territorio. En la actualidad es investigador responsable de un proyecto Fondecyt Regular sobre las ciudades y el territorio de la Araucanía entre 1850 a 1930 y de un proyecto Diufro que busca analizar la iconografía (fotografías y mapas históricos) que registran los procesos de cambio y continuidad en la Araucanía.

Fondecyt 2024/2028 – Fuertes, estaciones y misiones. El nacimiento y desarrollo de los centros urbanos en La Araucanía: 1850-1930

1. J. Flores. (2020). Procesos de significación y resignificación de una ciudad, Temuco 1881-2019. Arquitecturas del sur, vol.38, 32 – 51 , 0716-2677.
2. J. Flores, M. Fabregat. (2023). Organizacion sanitaria del ejercito del sur en la ocupación de la Araucanía: antecedentes sobre el desarrollo de la medicina militar en Chile (1870-1889). historia 396, vol.13, 185 – 216 , 0719-7969.
3. J. Flores, P. Martinez. (2020). La turistificación del territorio: viajeros y revistas de turismo en el sur de Chile, 1853-1950. Revista de geografía espacios, vol.10, 32 – 52 , 0719-7209.
4. J. Flores. (2023). Araucanía. Perspectiva sobre el territorio y la ruralidad , antiguas y nuevas territorialidades en la Araucanía, 1850-1950. RIL editores, 978-956-01-1503-4.
5. J. Flores, L. Castro. (2021). La américa indígena decimonónica desde nueve miradas y perspectivas , mapuches y andinos: el proceso de chilenización y lo étnico-territorial en el Chile de fines del siglo XIX. Prometeo, 978-987-8451-09.

Doctorado

1. N. Pareja. (2023). Trayectoria histórica del problema de la tierra en la araucanía rural: Subdesarrollo y conflictos campesinos/mapuches durante el siglo XX. Doctorado en Ciencias Sociales. Universidad de La Frontera.

Magíster

1. C. López. (2023). La Tierra mapuche antigua de Zagrüll De la tierra antigua, remates de tierras y títulos de merced. Magister de Ciencias Sociales aplicadas. Universidad de la Frontera.